Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sec24aQ3U2P1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sec24aQ3U2P1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sec24aQ3U2P1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sec24aQ3U2P1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sec24aQ3U2P1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sec24aQ3U2P1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sec24aQ3U2P1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms