Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms