Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms