Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdnep1Q3TP92 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdnep1Q3TP92 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdnep1Q3TP92 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms