Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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F13bQ07968 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
F13bQ07968 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms