Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms