Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm31463-201ENSMUST00000208799 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm44862-201ENSMUST00000207981 1055 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms