Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cxcr5Q04683 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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