Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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