Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlh1Q02576 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlh1Q02576 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlh1Q02576 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlh1Q02576 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlh1Q02576 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlh1Q02576 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms