Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms