Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms