Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms