Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms