Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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