Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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