Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TgfbiP82198 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms