Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gabpb2P81069 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gabpb2P81069 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms