Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms