Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UbdP63072 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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UbdP63072 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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UbdP63072 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UbdP63072 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UbdP63072 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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