Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Drosha-207ENSMUST00000169061 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Fam149b-210ENSMUST00000224721 4483 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms