Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Csrnp3P59055 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms