Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atp5bP56480 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms