Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgd1P52734 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms