Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms