Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpbP50405 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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