Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms