Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms