Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtlP38585 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtlP38585 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms