Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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