Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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