Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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