Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ggta1P23336 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ggta1P23336 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ggta1P23336 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ggta1P23336 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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