Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PparaP23204 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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