Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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