Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P20040 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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