Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms