Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms