Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Irf1P15314 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Irf1P15314 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Irf1P15314 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Irf1P15314 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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