Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms