Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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