Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcP06800 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcP06800 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms