Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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