Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01878 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01878 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01878 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01878 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01878 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01878 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01878 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms