Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01648 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01648 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01648 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01648 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01648 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01648 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01648 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01648 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms