Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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CopeO89079 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CopeO89079 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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CopeO89079 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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CopeO89079 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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CopeO89079 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CopeO89079 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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