Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChkaO54804 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms