Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DffaO54786 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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