Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms