Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Top6blJ3QMY9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Top6blJ3QMY9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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